PyMOL(三维分子模型软件) v2.2.0 官方版

　　PyMOL是一款功能强大且简单专业的三维分子模型制作软件，同时也是一个由用户支持的分子可视化系统，基于开放源代码，由Schrödinger维护和分发，为用户提供全面的分子可视化模型处理环境，使用这款软件用户可以进行专业便捷的三维分子模型处理；PyMOL功能丰富齐全、专业实用，集成的光线跟踪图形技术，可以渲染具有更平滑的表面边界，进而增强3D分子结构的阴影和反射效果，同时该软件支持多种图像格式导入导出，其中包括PDB、SDF以及电子密度图等格式文件，可让用户轻松得到符合要求的图像文件。

功能介绍

　　借助此分子可视化系统，可以以3D模式对蛋白质，其密度，轨迹和表面进行细微分析

　　原生视网膜分辨率/ 4k显示支持

　　停靠/取消停靠并重新排列某些面板(生成器，反馈浏览器，音量编辑器)

　　用于打开MAE文件，MTZ文件，地图和轨迹文件的专用对话框

　　新的APBS插件面板

　　pymolrc脚本编辑器，突出显示语法

　　属性编辑器

　　MPEG-4和GIF电影导出面板

　　Excel导出器插件(Windows和Mac)

　　通过从文件浏览器拖动到PyMOL窗口来打开文件

　　组合线/非粘合线和棒/ nb_spheres的导线和甘草制图表达别名

软件特色

　　1、支持原子级卡通透明度

　　2、支持多种图像格式导入导出

　　3、将对齐文件作为对齐对象加载

　　4、保存核酸的对齐文件

　　5、内置强大实用的绘图工具

      6、支持触控板手势控制

使用说明

　　1、完成软件下载双击软件弹出软件安装弹框，点击next按钮即可进行软件安装

　　2、完成软件安装后点击finish按钮即可关闭弹框并启动软件

　　3、弹出软件文件注册界面，该界面可以选择文件类型以向PyMOL注册它们

　　4、关闭注册弹框即可进入三维分组模型操作界面进行图像处理

　　5、点击软件左上角的文件按钮弹出软件文件新建、打开、保存、导入导出等功能列表，点击即可进行使用

　　6、点击打开按钮弹出文件管理弹框，点击选择文件即可进行文件添加

　　7、点击导出按钮可以将完成编辑处理的图像以多种格式导出软件

　　8、点击设置按钮可以对软件默认功能和参数进行设置和调整

更新日志

　　Bug修复

　　使用use_shaders = off和line / nonbonded进行拾取

　　显示预设中的SPC水

　　读取CMS文件时不要忽略插入代码

　　环境光遮挡随机斑块

　　对齐时更新dynamic_measures

　　修复“重建”内存泄漏

　　MPEG4导出像素化（anaconda :: ffmpeg与conda-forge :: ffmpeg）

　　旧版插件：使用模式对话框（macOS和Windows）修复崩溃

　　PyMOL v2.3.1维护版本（2019年3月28日）

　　Windows：修复HTTPS的SSL证书位置

　　处理Python 2 pymolpluginsrc语法错误

　　MAE导入：区分未定义的（<>）和值为“ <>”的字符串

　　MAE导出：将未定义的属性写为<>

　　MAE出口属性：b因子，部分费用，ANISOU

　　PyMOL v2.3.2维护版本（2019年5月17日）

　　修复stick_transparency射线跟踪

　　修复单击下部命令行崩溃的问题

　　修复等距抽奖

　　MAE导出：修复空白（空格）链标识符导出

　　macOS：插件管理器没有XQuartz依赖性

　　PyMOL v2.3.3维护版本（2019年8月21日）

　　使用Python 3修复cmd.load_raw（format =“ mmtf”）

　　MMTF：避免使用可选的groupType字段崩溃（MMTF v1.1dev功能）

　　修复插件管理器utf-8元数据

　　插件安装：忽略“测试”

　　修复macOS 10.15的文件对话框（不要使用本机对话框）

　　在macOS上修复Zalman立体声

　　音量面板：手柄pos <0.0

　　PyMOL v2.3.4维护版本（2019年11月7日）

　　改善macOS 10.15的兼容性

　　修复ray_volume回归

　　PyMOL v2.3.5维护版本（2020年3月6日）

　　修复macOS 10.15的macOS捆绑包的公证

　　使用“ pseudoatom”修复崩溃；h_add”

　　修复损坏的CGO对PSE的加载

　　修复带有UTF-8标签的PSE加载（Python 3版本）